这个故事发生在战国时期。少年坦太郎(加藤清次郎饰)出生于三流贫苦忍者家庭，肩负父母的期望，进入了由天才忍者大川浩(平干二朗饰)首创的一流忍者学校————忍者学校。他现在虽然老了，但武功依然高超，而且还在不断地耍花招。他还带领忍者学校和他的对手藤田哈方斋(松方弘树)一起推出了一系列的atrix。忍者学校的学生被称为“忍者的蛋”(简称“忍蛋”)，銮太郎入读年叶组(年组)。在这里，他遇到了一个新成员魏(木村丰臣饰)，一个富商的儿子和吴万(林饰)，他们的父母被杀害。三个小家伙组成了根深蒂固的三重奏。从那以后，他们忙于补习，重考。有一天，出生在理发师家庭的齐藤万英(沟口拓也饰)和他的父亲齐藤兴隆(鹿贺丈史饰)在家中遭到刺客万寿鸟(竹中直人饰)和土寿鸟(莫忧石垣饰)的袭击。原来，齐藤父子是八芳斋毒竹忍者团的成员。虽然他们已经离开了这个邪恶的组织，但天剑仍在穷追不舍，并发誓要杀死齐藤父子。在这个关键时刻，导演和八芳斋约定要打。只要忍者派能冲进毒竹山，敲响大明寺的钟声，天剑就会彻底抛弃齐藤父子。俗话说，初生牛犊不怕虎。在高年级学生的支持下，高一的孩子们决定挑战这场艰难而危险的决斗。一方面是高一新生，一方面是有着丰富实践经验的职业忍者。他们能赢得最后的胜利吗？